Catálogo de Investigaciones | 2011-2012

37 Catálogo de Investigaciones | Pontificia Universidad Católica de Puerto Rico Análisis bioinformático de secuencias de cinco proteínas de organismos desconocidos La bioinformática es un campo interdisciplinario que integra aspectos de la biología, matemática, informática y computación, entre muchas ramas de la ciencia para la generación de data biológica, médica, de la conducta o de la salud y que nos ayuda a adquirir, almacenar, analizar o visualizar de una forma más accesible dicha data. Las herramientas brindadas por este campo son usadas para hacer sentido de los billones de secuencias generadas por los proyectos genómicos. Se seleccionaron cinco secuencias de proteínas de organismos recién descubiertos cuyos genomas fueron depositados en las bases de datos del NCBI. Estas están siendo estudiadas para determinar sus características físico-químicas, predecir modificaciones post-traducción, estructura secundaria y terciaria, dominios funcionales de las proteínas, posibles interacciones proteína-proteína y proteína-DNA. Por ejemplo, se predijo que la proteína AEX30512.1 NP1 [ Porcine bocavirus 5/ JS677] es muy similar al “ human bocavirus ” y a otras proteínas de bocavirus porcino conocidas. Resulta interesante saber que se predijo lugares de fosforilación y glicosilación en varios aminoácidos y la estructura secundaria esta dominada por  -hélice. Las herramientas bioinformáticas que se están utilizando para obtener estos datos incluyen BLAST, ProtParam, NetPhos, PsiPred, STRING, InterProScan, entre otras. Analizar secuencias de proteínas, mediante técnicas bioinformáticas, de organismos de los cuales se conoce muy poco o nada es sumamente importante. Este estudio proteómico podría proveer información funcional valiosa para conocer los procesos biológicos y redes regulatorias o metabólicas de estos organismos. Los resultados de esta investigación contribuirán al diseño de proyectos genómico- funcionales que ayuden a entender la función y posibles aplicaciones médico-tecnológicas de dichas secuencias. sheila m. ruiz acosta mentor dra. mónica m. arroyo bioinformática bioquímica estructural genómica funcional